Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ercc8Q8CFD5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc8Q8CFD5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms