Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrc9Q8CDN9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrrc9Q8CDN9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lrrc9Q8CDN9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms