Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bcas3Q8CCN5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bcas3Q8CCN5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bcas3Q8CCN5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms