Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms