Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apoa5Q8C7G5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Apoa5Q8C7G5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms