Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rft1Q8C3B8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rft1Q8C3B8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms