Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms