Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Actrt3Q8BXF8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actrt3Q8BXF8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms