Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor1Q8BX46 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor1Q8BX46 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms