Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slx1bQ8BX32 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Slx1bQ8BX32 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms