Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx17Q8BVL3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx17Q8BVL3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms