Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia2Q8BSS9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia2Q8BSS9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia2Q8BSS9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms