Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ckap4Q8BMK4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap4Q8BMK4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms