Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms