Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prune1Q8BIW1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prune1Q8BIW1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prune1Q8BIW1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms