Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gabra5Q8BHJ7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms