Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmco3Q8BH01 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmco3Q8BH01 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms