Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX3

Lrtm2, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm2Q8BGX3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrtm2Q8BGX3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrtm2Q8BGX3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms