Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGB5

Limd2, LIM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd2Q8BGB5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Limd2Q8BGB5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Limd2Q8BGB5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Limd2Q8BGB5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Limd2Q8BGB5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Limd2Q8BGB5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Limd2Q8BGB5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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