Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ctdspl2Q8BG15 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctdspl2Q8BG15 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms