Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Kdm5bQ80Y84 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm5bQ80Y84 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5bQ80Y84 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms