Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Pcsk9Q80W65 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Pcsk9Q80W65 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Pcsk9Q80W65 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Pcsk9Q80W65 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Pcsk9Q80W65 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Pcsk9Q80W65 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Pcsk9Q80W65 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pcsk9Q80W65 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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