Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube3cQ80U95 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3cQ80U95 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3cQ80U95 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms