Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul9Q80TT8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul9Q80TT8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul9Q80TT8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms