Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prrc2bQ7TPM1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prrc2bQ7TPM1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.3 ms