Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mycbp2Q7TPH6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mycbp2Q7TPH6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Mycbp2Q7TPH6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms