Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPC1

Cdsn, Corneodesmosin, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdsnQ7TPC1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdsnQ7TPC1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdsnQ7TPC1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdsnQ7TPC1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdsnQ7TPC1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdsnQ7TPC1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CdsnQ7TPC1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CdsnQ7TPC1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CdsnQ7TPC1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms