Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Smap2Q7TN29 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smap2Q7TN29 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms