Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf2Q7TMI3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms