Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ppp1r3cQ7TMB3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms