Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd2Q7JJ13 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd2Q7JJ13 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms