Protein–RNA interactions for Protein: Q78EE2

Gm21292, Predicted gene, 21292, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21292Q78EE2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21292Q78EE2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21292Q78EE2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms