Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssh1Q76I79 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssh1Q76I79 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms