Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv1Q704Y3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpv1Q704Y3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms