Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms