Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl35Q6ZWV7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl35Q6ZWV7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl35Q6ZWV7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms