Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx55Q6ZPL9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ddx55Q6ZPL9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms