Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcl3Q6W5C0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcl3Q6W5C0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms