Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd300lfQ6SJQ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd300lfQ6SJQ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms