Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudcd1Q6PIP5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nudcd1Q6PIP5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms