Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NfrkbQ6PIJ4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms