Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx13Q6PHS6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx13Q6PHS6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms