Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasa4Q6PFQ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasa4Q6PFQ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasa4Q6PFQ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasa4Q6PFQ7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasa4Q6PFQ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasa4Q6PFQ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasa4Q6PFQ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasa4Q6PFQ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasa4Q6PFQ7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasa4Q6PFQ7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms