Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scaf4Q6PFF0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scaf4Q6PFF0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms