Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc36Q6PDM4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc36Q6PDM4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms