Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SvoplQ6PDF3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms