Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mfsd13aQ6PDE8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms