Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fhod1Q6P9Q4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fhod1Q6P9Q4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fhod1Q6P9Q4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms