Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp49Q6P9L4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms