Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp12Q6P5B0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp12Q6P5B0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms